Detección del punto de control de elongación transcripcional

Bucle de horquilla de pre-ARNm. Resalte las bases nucleares (verde) y la columna vertebral de ribosa-fosfato (azul). Tenga en cuenta que se trata de una sola hebra de ARN que se pliega sobre sí misma. Crédito: Vossmann / Wikipedia

Los científicos de Northwestern Medicine han identificado un punto de control crítico en el alargamiento de la transcripción, el proceso de hacer ARN a partir de una plantilla de ADN, según los resultados publicados en célula molecular.


Según el estudio, la presencia de un proteína SPT5 se denomina ‘pasaporte’, para determinar si se permite que el complejo de polimerasa avance a lo largo del ADN o, alternativamente, se degrade y se dañe.

“Solo la ARN polimerasa II con SPT5 puede salir de la estación”, dijo Ali Shelativard, PhD, profesor de Bioquímica y Genética Molecular Robert Francis Forchgot y autor principal del estudio.

Muchos experimentos de biología molecular funcionan eliminando el gen, o la proteína que codifica el gen, y observando el efecto, lo que indica la función de ese gen. Sin embargo, estos métodos a menudo producen otras mutaciones o requieren una espera de 72 horas antes de la observación, lo que permite que se produzcan más procesos de transcripción.

Chelatevard, quien también es profesor de pediatría, director del Instituto de Epigenética Simpson Querrey y miembro del Instituto Robert H. Universidad.

Crédito: Universidad Northwestern

Un nuevo método experimental, llamado hidrólisis inducida por auxinas, permite un seguimiento inmediato de los efectos del agotamiento de las proteínas. En el estudio, los investigadores utilizaron este método para interrogar el papel de la proteína SPT5 en el alargamiento transcripcional.

Durante Alargamiento de la transcripción, el complejo de ARN polimerasa II “camina” a lo largo de una sola hebra de ADN, transcribiendo elementos genéticos en una hebra de ARN. El laboratorio de Chelatevard ha detectado previamente pausas en este proceso vinculadas a los puntos de control regulatorios. Ahora, utilizando este nuevo método de eliminación de genes, han descubierto un punto de control crítico antes de que comience el alargamiento.

En las células donde se ha agotado SPT5, la polimerasa nunca comienza su viaje por la cadena de ADN. En cambio, se reconoce como defectuoso y decadente. Aún se desconoce exactamente cómo se identifica, pero SPT5 claramente sirve como una insignia de aprobación, según Yuki Oi, PhD, becario postdoctoral en el laboratorio de Chelatevard y autor principal del estudio.

“Si hay problemas aquí, y polimerasa “Lo dejaron pasar, podría haber más problemas”, dijo Aoi, “Solo dejaron pasar la polimerasa aprobada porque tienen SPT5”.

Los investigadores también descubrieron que una proteína llamada CUL3 es parte de la vía que destruye los polímeros que carecen de SPT5. El gen que codifica esta proteína y lo que está asociado a ella. genes Está mutado en muchos cánceres, lo que puede permitir que comiencen las polimerasas desnaturalizadas. Copiar Journey conduce a células anormales que pueden contribuir al cáncer. Esta es una ruta de gran importancia, según Aoi.

“Necesitamos examinar esta asociación con el cáncer”, dijo la organización.


Ensayo de dificultades de transcripción de ARNm


más información:
Yuki Aoi et al, estabilización SPT5 de la ARN polimerasa proximal del segundo promotor, célula molecular (2021). doi: 10.1016 / j.molcel.2021.08.006

Introducción de
Northwestern University

La frase: Punto de control de elongación de la transcripción descubierto (2021, 6 de septiembre) Recuperado el 6 de septiembre de 2021 de https://phys.org/news/2021-09-transcription-elongation-checkpoint.html

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