Detector de ADN revela krill antártico oculto

kril antártico. Crédito: Pete Harmsen

Al igual que los investigadores forenses, los científicos pueden usar técnicas moleculares para descubrir evidencia de krill antártico en muestras de agua de mar recolectadas en el Océano Austral. La tecnología revolucionaria puede identificar el ADN del krill antártico dentro de la sopa de letras de las moléculas de ADN arrojadas por muchas otras criaturas marinas, incluidas las bacterias, otras especies de krill y las ballenas.


Ahora, por primera vez, un nuevo método de espionaje molecular puede señalar cuándo la Antártida está kril Dejaron su muestra de ADN en una «escena».

La investigación, dirigida por la Dra. Leonie Suter, analista de «ADN ambiental» de la División Australiana de la Antártida, promete proporcionar información sobre los hábitats oceánicos que favorece el krill, incluidos los hábitats de aguas profundas y subglaciales que son difíciles de estudiar de otras maneras.

«Hay muchas áreas en el Océano Austral donde estamos casi ciegos cuando se trata de detectar krill», dijo el Dr. Sutter. «La nueva tecnología que hemos desarrollado nos permite estimar si el ADN del krill que se mueve en el agua se desprendió recientemente o si es más antiguo. Poder detectar estos fragmentos de ADN nos permitirá buscar donde no hemos estado». «capaz de mirar antes. Esto puede ayudarnos a comprender cómo el krill usa estos hábitats y contribuir a estimaciones más precisas de abundancia y distribución utilizadas para administrar la pesquería».

Encuentra fragmentos

La tecnología se basa en el hecho de que, dentro de las células de todos los seres vivos, largas hebras de ADN comienzan a descomponerse o romperse en pedazos más pequeños cuando las células mueren y el ADN se libera al medio ambiente. En el krill, esto incluye cuando defeca y cuando «muda» y muda su exoesqueleto duro.

«El ADN eliminado recientemente se presenta como fragmentos más largos, mientras que el ADN más antiguo se descompone en fragmentos más pequeños», dijo el Dr. Sutter.

Para aprovechar esto, el equipo desarrolló marcadores moleculares que les permiten determinar si las muestras de agua contienen más segmentos «jóvenes» más largos o segmentos «viejos» más cortos.

La proporción de fragmentos cortos a largos en cada muestra de agua indica si el ADN se ha eliminado recientemente o no.

«Con este nuevo método molecular, si tomamos una pequeña muestra de agua del fondo del mar, por ejemplo, podemos detectar la presencia de krill a partir de los pequeños rastros de ADN que dejan», dijo el Dr. Sutter. «Si detectamos muchos fragmentos largos de ADN, podemos decir que es probable que el krill haya estado usando su hábitat de aguas profundas recientemente. Si encontramos más fragmentos cortos, es probable que este material haya estado flotando por un tiempo y podría haber llegado de otro lugar, incluida la superficie.» «.

Manejo de pesquerías de krill

El Dr. Sutter dijo que el método podría ayudar a la gestión de las pesquerías de krill al permitir a los científicos medir la abundancia y distribución del krill en nuevos hábitats a los que de otro modo sería difícil acceder a las técnicas tradicionales de medición basadas en barcos.

«Cada vez hay más pruebas de que el krill usa las profundidades marinas como un hábitat superficial alternativo, alimentándose de fitoplancton. Pero es difícil monitorear el fondo del mar con instrumentos acústicos y redes de arrastre, ya que generalmente está confinado a un área alrededor del barco». Ella explicó.

«Para gestionar eficazmente las pesquerías de krill, necesitamos saber qué tan abundante es el krill. Pero si solo mides el krill en la superficie, podrías perderte una gran proporción de los animales en aguas más profundas, por lo que las estimaciones de abundancia no serán precisas».

Acuario a la Antártida

El equipo desarrolló la tecnología en experimentos de laboratorio en el Acuario de Krill del Departamento Antártico de Australia antes de probarla. muestras de agua de mar Recolectado durante un viaje de reabastecimiento en la Antártida.

El equipo ahora comparará su método de ADN con otros métodos de estudio de krill, incluidos la acústica y la pesca de arrastre.

“Durante una gran prospección de krill frente a la Antártida oriental en 2021, viajamos a través de cardúmenes de krill y recolectamos muestras del agua entre la superficie y Fondo del mar. También rastreamos y medimos los enjambres utilizando la acústica, las redes de arrastre y las miras ópticas del barco».

«Sería interesante usar nuestros marcadores de ADN en muestras de agua para ver cómo los resultados complementan los datos recopilados por otros métodos. ¿Podemos hacer comparaciones directas? Estoy realmente entusiasmado con la posibilidad».

Publicación de la investigación en la revista. ADN ambiental.

más información:
Leonie Suter et al, Environmental DNA of Antarctic krill (Euphausia superba): la cuantificación de la fragmentación del ADN añade un aspecto temporal a los estudios cuantitativos, ADN ambiental (2023). DOI: 10.1002/edn3.394.500

Proporcionado por el Programa Antártico Australiano

La frase: El detector de ADN expone el krill antártico oculto (23 de enero de 2023) Obtenido el 23 de enero de 2023 de https://phys.org/news/2023-01-dna-detector-exposes-hidden-antarctic.html

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