El salvaje mundo de las proteínas plasmáticas

Es probable que sus diversos intereses, experiencias y exposición a diferentes campos científicos le hayan proporcionado conocimientos valiosos. Como alguien que ha navegado por este terreno, ¿cómo guía a alguien que quiere tener un impacto en la ciencia pero no está seguro de qué camino tomar?

para comenzar; Únete a nuestra comunidad científica y contribuye. La ciencia es convincente y se comunica a través de las fronteras y las barreras del idioma. Mi consejo es que sigas tu curiosidad y hagas lo que te emociona porque trabajar en los temas que te encanta trabajar será el combustible para motivarte y seguir adelante.

Es importante recordar que la investigación es un viaje impredecible y es posible que los resultados no siempre coincidan con sus expectativas. La mayoría de las veces, las cosas no salen como se esperaba, porque con cada paso y cada día que investigas, te adentras en un territorio nuevo e inexplorado y los resultados suelen ser inciertos. Mantenerse motivado y comprometido no es fácil porque no siempre funciona como se espera.

También quieres ser un poco estratégico y pensar dónde quieres estar. Si desea volverse académico, considere una biología más enfocada, ya que eso es lo que busca la gente. Busque orientación de colegas y mentores que ya hayan alcanzado el nivel al que aspira, y conéctese con habilitadores en su campo de estudio elegido para ayudarlo a dar el siguiente paso.

¿Lograste aprovechar alguno de esos momentos eureka, o momentos «Dios mío», donde algo se une y tienes la próxima idea brillante?

Estos son los momentos de los que quiere estar cerca porque son los poderosos motivadores que lo mantienen avanzando. Creo que estar fascinado por la complejidad de la naturaleza siempre ha sido un momento ‘Dios mío’.

Cuando me uní al laboratorio de Matthias Mann durante mi doctorado, estuve expuesto a nuevas técnicas de espectrometría de masas. Toma solo unos pocos microgramos de una muestra biológica y obtiene decenas de miles de partículas. Puedes ver todas estas diferentes partes móviles y comprender cómo se construye la vida. Los datos le permiten abordar preguntas específicas de la enfermedad, lo cual es muy emocionante.

Un buen ejemplo de esto es lo que se hace posible con las nuevas herramientas de IA como chatGPT. Así es como la ciencia y la tecnología pueden avanzar. Estos momentos inesperados. ChatGPT conecta el conocimiento y crea contexto a partir de una gran cantidad de información que se puede utilizar en la investigación. Creo que hay más por venir, y solo estamos arañando la superficie de lo que es posible. Es un buen momento para investigar.

Crédito de la imagen: espectrometría de masas de ciencias biológicas de Bruker

¿Puede arrojar algo de luz sobre los desafíos en el campo de las proteínas plasmáticas y explicar cómo Sir los está abordando de una manera nueva e importante?

Las proteínas son las entidades funcionales en las células. Determinan la forma de una célula, cómo interactúa con otras células y actúan como moléculas de señalización. Definen el fenotipo. Los fenotipos son muy complejos y están directamente relacionados con la complejidad bioquímica, lo que hace que el análisis de proteínas sea excepcionalmente complejo.

También tenemos el desafío de que las proteínas tienen rangos de abundancia y concentraciones muy diferentes. Esto significa que será más difícil identificar pequeñas concentraciones al profundizar en la muestra biológica que en la muestra anterior.

Seer ha creado tecnología con la que puede profundizar en las proteínas plasmáticas y otras muestras biológicas complejas al comprimir grandes cantidades de información en una forma más fácil de manejar en un detector posterior, como un espectrómetro de masas.

Nuestro enfoque implica la ingeniería de nanopartículas con propiedades superficiales específicas que interactúan con una proteína, formando conjuntos moleculares complejos llamados proteínas corona. Estos conjuntos se pueden ajustar de forma selectiva para capturar subconjuntos específicos del espacio físico y químico de una proteína, lo que permite la compresión de información para el análisis de espectrometría de masas sin necesidad de subconjuntos de proteínas específicas.

Hemos desarrollado una tecnología central que proporciona un flujo de trabajo escalable, automatizado y accesible para el análisis de muestras biológicas. Este enfoque le permite utilizar la última tecnología de radar de especificación de masas para obtener la complejidad de la información molecular capturada en la superficie de un producto.

Crédito de la imagen: espectrometría de masas de ciencias biológicas de Bruker

El campo de las proteínas plasmáticas enfrenta muchos desafíos que podrían limitar el progreso y el descubrimiento. ¿Cuáles son algunos de los obstáculos más importantes que enfrenta actualmente el campo y qué pasos se pueden tomar para superarlos?

El desafío histórico es combinar profundidades de cobertura con rendimiento. Otro desafío es cómo integramos modificaciones postraduccionales y estructuras de proteínas únicas para generar datos más completos y biológicamente significativos.

Cada proteína probablemente existió en algún momento en una forma diferente llamada proteína. Es una entidad molecular diferente que puede tener un papel específico en una enfermedad particular. Esto debe tenerse en cuenta en la preparación de muestras, el procesamiento de especificación de masas de péptidos y en la interpretación y los datos biológicos. Esto es algo que creo que será cada vez más importante y nos permitirá agregar un significado biológico a los datos que se generan.

Otro desafío es acercar a la comunidad. No tendremos una comunidad de genómica, proteómica y metabolómica en el futuro, pero tendremos una comunidad de personas que quieran diseccionar la composición molecular de la vida.

Para comprender realmente cómo funciona la vida y cómo se oscurece en el contexto de la enfermedad, debemos reunir estas comunidades, tecnologías y conocimientos de datos. Esto cambiará radicalmente la forma en que entendemos la investigación biomédica o avanzará en la investigación biomédica para desarrollar estrategias de diagnóstico y tratamiento más efectivas para enfermedades complejas..

¿Cuáles son tus mayores esperanzas para este año y el destino?

El producto ha estado en manos de los clientes desde hace un tiempo. Veremos las primeras publicaciones en revistas revisadas por pares. Esto es muy emocionante, no solo porque vemos cómo las personas lo usan para responder preguntas biológicas, sino también para las personas que trabajan en Seer, y ven lo que las personas pueden hacer con la tecnología.

Estoy seguro de que harán cosas que no esperábamos, que será otro momento eureka. Queremos aprender, obtener retroalimentación, entender lo que funciona bien, pero también queremos entender lo que tenemos que mejorar.

Las preguntas que haremos son: ¿lo que sigue? ¿Hacia dónde podemos llevar la tecnología? ¿Cuáles son los puntos débiles actualmente cuando se quiere investigar una enfermedad? ¿Cómo podemos ayudar? ¿Cómo podemos colaborar como comunidad?

Esto es muy emocionante porque trabajamos y reunimos tecnologías y luego vemos qué grandes conocimientos podemos generar.

sobre el altavoz

Daniel Hornberg, Vicepresidente de Proteómica Sir

Daniel es un líder científico consumado en análisis a microescala, que utiliza una combinación de experiencia académica e industrial para desarrollar e implementar de manera efectiva soluciones multiómicas, con experiencia práctica y de liderazgo comprobada en el análisis de proteínas, metabolitos y lípidos, con especificación de masas. e interpretación. Datos moleculares a través de estrategias personalizadas de aprendizaje automático. Tiene una sólida experiencia en impulsar el avance tecnológico y descubrir nuevos conocimientos biológicos en entornos de ritmo acelerado, como empresas de nueva creación y en etapa inicial.

Dios mío, anfitrión de OMx: Kate Stambaugh, gerente sénior de mercado en Bruker

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Acerca de la espectrometría de masas para las ciencias de la vida Bruker

Descubra nuevas formas de aplicar la espectrometría de masas a los desafíos analíticos más apremiantes de la actualidad. Innovaciones como Movilidad de iones atrapados (TIMS)y la tecnología FTMS (XR) de resolución máxima y resolución de píxeles inteligente MALDI-MS, capaz de detectar firmas de estructura fina (IFS) de isótopos, impulsa la exploración científica a nuevas alturas. Corredor Las soluciones de espectrometría de masas permiten a los científicos realizar descubrimientos revolucionarios y obtener conocimientos más profundos.