Un estudio de la dinámica viral de individuos infectados con omicron y delta

Durante la pandemia del coronavirus 2019 (COVID-19), muchos gobiernos federales de todo el mundo han instituido reglas de aislamiento para evitar la transmisión del SARS-CoV-2 de personas infectadas a otras. Debido a que el aislamiento puede tener un impacto significativo tanto en la economía de un país como en la salud mental de sus ciudadanos, es imperativo que se realicen esfuerzos para reducir los períodos de aislamiento y, al mismo tiempo, evitar que las personas infectadas propaguen enfermedades.

estancia: Dinámica viral de las variantes Omicron y Delta SARS-CoV-2 con implicaciones para el momento de la liberación del aislamiento: un estudio de cohorte longitudinal. Haber de imagen: GoodStudio/Shutterstock.com

En un estudio reciente publicado en el servidor de preimpresión medRxiv *Y el Investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Boston examinan los períodos infecciosos en personas vacunadas con las variantes SARS-CoV-2 Omicron y Delta.

sobre estudiar

En el estudio de cohorte actual, los estudiantes y el personal de la Universidad de Boston (BU) se inscribieron después de un diagnóstico de COVID-19 mediante el ensayo de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR). Los participantes completaron un cuestionario inicial y luego se les pidió que realizaran controles de síntomas diarios y frotis nasales frontales, con registros guardados para el personal.

Algunos participantes inscritos también eligieron el estudio de prueba de antígeno de diagnóstico rápido (RDT) y se les proporcionaron tres kits de autoevaluación en los días 4 a 6 después del diagnóstico y se les pidió que proporcionaran una imagen de la tira reactiva al personal para interpretar los resultados. Los aislamientos obtenidos se analizaron mediante RT-PCR utilizando el ensayo de doble objetivo SARS-CoV-2, mientras que las secuencias virales se determinaron utilizando la plataforma Illumina.

Si la secuencia de aislamiento de diagnóstico no estaba disponible en el momento del muestreo, la determinación de la variante dependía del momento del diagnóstico. Junto con RT-PCR, se incubaron 200 μl de cada muestra con células Caco2 durante cuatro días, y se utilizó microscopía celular fija e indirecta para determinar la presencia de la repetición SARS-CoV-2.

Las características demográficas y clínicas de los participantes afectados se compararon con la variable delta u omicron según la positividad del cultivo después del día 5, el tiempo de conversión del cultivo y la duración de los cultivos positivos. Se utilizaron gráficos de dispersión y modelos de efectos mixtos de ajuste para evaluar la relación entre los valores del umbral del ciclo (ct) y el tiempo desde el inicio del diagnóstico/síntoma, todos los cuales fueron generados por la variable y el estado de vacunación.

Se usaron modelos mixtos aditivos generalizados para realizar ajustes curvilíneos y se usó un segmento B cúbico de cuatro nodos para integrar las vías de Ct. Se crearon gráficos de Kaplan-Meier para considerar cuándo se transformó la cultura para todo el grupo, así como por variable y estado de inmunización. Los valores medios de Ct al diagnóstico se compararon mediante pruebas no paramétricas de Wilcox, y la sensibilidad y especificidad de la PDR se compararon con la positividad del cultivo en los días 4-6.

Resultados

Un total de 92 participantes se inscribieron en el estudio, de los cuales 17 tenían la variante delta y otros 75 tenían la variante omicron. Sesenta y cinco de los participantes tenían síntomas en el momento del diagnóstico.

Evolución de los valores umbral del ciclo N1 PCR desde (a) el diagnóstico y (b) el inicio de los síntomas y el crecimiento del cultivo desde (c) el diagnóstico y (d) el inicio de los síntomas.

Todos los participantes recibieron al menos dos dosis de la vacuna COVID-19. Además, 32 personas con omicron recibieron una dosis de refuerzo en comparación con una persona con delta.

Alrededor del 84 % de las personas que recibieron una prueba positiva tuvieron una seroconversión el día 6 en comparación con el 71 % de las personas desde el inicio de los síntomas. Cuarenta y cuatro pacientes no tenían aislamientos positivos para trasplante.

Luego, los investigadores cambiaron los cálculos para examinar el tiempo desde el inicio de los síntomas en lugar del diagnóstico, normalizando ligeramente los datos. El modelo de efectos mixtos de lisis viral intrahuésped desde el inicio sintomático mostró estabilidad en el período presintomático en comparación con una disminución gradual en la lisis de la carga viral intrahuésped a lo largo del tiempo desde el diagnóstico.

Tanto las variables delta como omicron no mostraron diferencias significativas en el tiempo de transformación del cultivo viral, con tendencias de degradación viral dentro del huésped similares para ambas variables. Los participantes que recibieron la dosis de refuerzo tenían más probabilidades de mostrar una degradación viral más lenta dentro del huésped; Sin embargo, las tasas de transducción viral fueron similares y los valores de Ct fueron más altos en los individuos de refuerzo infectados con omicron.

En el estudio de dispositivos médicos RDT, la sensibilidad de las pruebas fue del 100 % en los días 4 a 6 y la especificidad fue del 86 %. Todas las pruebas negativas fueron negativas en ambos casos, lo que resultó en un valor predictivo negativo del 100 % y un valor predictivo positivo del 50 %.

Las curvas de Kaplan-Meier indican los días desde el diagnóstico hasta el cultivo viral negativo de todos los participantes (a), la variante de SARS-CoV-2 y el estado de vacunación (b).

Conclusiones

El estudio actual demuestra que el período infeccioso para el SARS-CoV-2 en la mayoría de los adultos jóvenes y adultos sanos y vacunados es muy limitado, y solo el 17% sigue siendo positivo después de cinco días. Además, se descubrió que la variante delta era infectiva durante un período más prolongado en comparación con la variante Omicron, con un tiempo medio de transformación del cultivo de tres días y dos días, respectivamente.

Al examinar los dispositivos médicos RDT, el valor predictivo negativo fue del 100 %; Sin embargo, el valor predictivo positivo puede causar problemas si estas pruebas son utilizadas por personas que actualmente se encuentran en cuarentena. En conjunto, los resultados del estudio actual pueden ayudar a informar a los responsables de las políticas de salud pública sobre el establecimiento de reglas de aislamiento.

*Nota IMPORTANTE

medRxiv Publica informes científicos preliminares que no han sido revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, orientar la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud ni tratarse como información establecida.